《红磨坊电影》在复仇者联盟众英雄的努力下于灭霸无限手套事件中化作为灰烬的人们重新回到了人世间曾经消失的蜘蛛侠 彼得帕克 也回归到了普通的生活之中数月后蜘蛛侠彼得帕克所在的学校举行了欧洲旅游帕克也在其中 在欧州威尼斯旅行时一个巨大无比的水怪袭击了威尼斯不敌敌人的蜘蛛侠幸得一位自称神秘客的男子搭救才击退敌人之后 神盾局局长找上正在旅游的彼得帕克并要求其加入神盾局并安排神秘客协助帕克神秘客自称来自其他宇宙并告知一群名为元素众的邪恶势力已经入侵这个宇宙了为了守护来之不易的和平蜘蛛侠决定与神秘客联手然而在神秘客那头罩之中似乎隐藏着什么不为人知的真相……一个清纯的魔术师女孩朱灵妍本身过着平静的生活一个噩耗却夺走了她所拥有的一切爱她的义父身亡护她的义兄韩忆居然是凶手这猝不及防的一切都让单纯的她手足无措为寻找真相她根据义父程林笙留下的线索去寻仇在寻找过程中朱灵妍等人受到阻挠却不料牵扯出连环杀人案凶手指向韩忆辛父说出尘封二十余年的往事更是说出了魔术世家龟甲的秘密为钓出韩忆朱灵妍与侦探辛武假意结婚骗韩忆前来抢夺龟甲阻止婚礼韩忆被抓却说自己所为另有苦衷韩忆为获得朱灵妍信任说出藏龟甲所在地并说出七星曜日的秘密龟甲取出后引来程林笙为了保护朱灵妍辛武不幸被害程林笙夺走龟甲一切真相又扑朔迷离起来为了救神谷薰(武井咲饰)绯村剑心(佐藤健饰)纵身跃入大海昏迷中他飘到某座小岛最终为传授了他飞天御剑流的师父比古清十郎(福山雅治饰)所救深感到自身与志志雄真实(藤原龙也饰)的巨大差距为了拯救全日本剑心恳请师傅传授他飞天御剑流的最高奥义与此同时志志雄剑指东京迈出武力夺国的下一步他强迫伊藤博文(小泽征悦饰)对刽子手拔刀斋发布全国通缉令得知消息的薰、左之助(青木崇高饰)则匆匆向东京赶去再度上路的剑心率先遭到御庭番众的首领四乃森苍紫(伊势谷友介饰)的阻击他一路披荆斩棘将迎来与宿命的对手志志雄最终的对决……本片根据和月伸宏的同名经典漫画改编...